Τα τέσσερα τελευταία επεισόδια του The Clone Wars διαδραματίζονται ταυτόχρονα με το Revenge of the Sith, την τελευταία ταινία της τριλογίας prequel του Star Wars. Αυτό περιλαμβάνει το Τάγμα 66 και την πτώση του Τάγματος Τζεντάι.
Μια άγνωστη πτυχή του Star Wars ήταν πώς η αγαπημένη των θαυμαστών Ahsoka Tano επέζησε από το Order 66. Τα δύο τελευταία επεισόδια της σειράς δείχνουν πώς η Ahsoka δραπέτευσε.
Sshattered
Στο ένατο και δέκατο επεισόδιο της σεζόν, ο Darth Maul έστησε μια παγίδα σκοπεύοντας να σκοτώσει τον Anakin Skywalker προτού ο Darth Sidious τον γυρίσει στη σκοτεινή πλευρά. Ωστόσο, ο Anakin ήταν απασχολημένος με τη διάσωση του Καγκελάριου Palpatine από τον στρατηγό Grievous όπως απεικονίζεται στην εναρκτήρια σειρά του Revenge of the Sith. Έτσι, η Ahsoka αντιμετώπισε τον Maul. Το δέκατο επεισόδιο τελειώνει με τη σύλληψη του Maul.
Ο δρομέας της σειράς Dave Filoni είπε στο Entertainment Weekly, «Κάτι που ήθελα να κάνω εδώ και πολύ καιρό είναι να είναι το τέλος του Clone Wars αυτή η συμπίπτουσα ιστορία που πλαισιώνει μερικούς από αυτούς τους ανθρώπους που δεν συμμετείχαν. Οι ταινίες είναι. Επειδή νομίζω ότι αυτό και μόνο είναι μια έγκυρη ερώτηση: Πού ήταν αυτοί οι τύποι; Η Ahsoka φαινόταν ότι ήταν σημαντική, οπότε την προσκάλεσαν να συμμετάσχει στους Sith; Πού ήταν ο Rex; Ένιωσα ότι χρειαζόταν μια απάντηση γιατί ήταν, μετά από τόσα επεισόδια και ιστορίες, προφανώς ένα τόσο μεγάλο μέρος της ζωής του Anakin και του Obi-Wan."
Στο ενδέκατο επεισόδιο, με τίτλο "Sshattered", η Ahsoka προσπαθεί να φέρει τον Maul στο Coruscant με έναν διοικητή κλώνο που ονομάζεται Rex και ένα τάγμα κλώνων στρατιωτών. Εμφανίζονται περισσότεροι σύνδεσμοι για το Revenge of the Sith. Μια σκηνή από την ταινία αναδημιουργείται. Στη σκηνή, ο Mace Windu και ο Yoda συζητούν για τον Palpatine και την απομάκρυνσή του από το γραφείο μετά την ήττα του στρατηγού Grievous με άλλα μέλη του συμβουλίου Jedi. Η σκηνή επεκτείνεται με μια ακόλουθη συζήτηση με την Ahsoka.
Ενώ εξακολουθούν να ταξιδεύουν στο διάστημα, η Ahsoka και ο Maul αισθάνονται και οι δύο την πτώση του πρώην κυρίου της Ahsoka. Η πραγματική ηχογράφηση διαλόγου από το Revenge of the Sith με τους Hayden Christensen, Samuel L. Jackson και Ian McDiarmid ως τους αντίστοιχους χαρακτήρες τους να παίζουν στη σκηνή.
Μετά τη σειρά του Anakin, ο Sidious ενεργοποιεί την Τάξη 66. Τα τσιπ αναστολέα τοποθετήθηκαν σε κάθε κλώνο στρατιώτη. Όταν δηλώνεται το Τάγμα 66, αναγκάζονται να σκοτώσουν κάθε Τζεντάι παρά τη θέλησή τους. Μόλις δοθεί η εντολή, ο Ρεξ και οι κλώνοι του επιτίθενται στον Αχσόκα.
Νίκη και Θάνατος
Με την ελεύθερη βούληση του Rex αποκατασταθεί, οι δυο τους προσπαθούν να ξεφύγουν από το καταδρομικό Republic στο φινάλε της σειράς με τίτλο "Victory and Death". Αυτό γίνεται πιο περίπλοκο από τον Maul που καταστρέφει το hyperdrive του πλοίου. Αυτό καθιστά το καταδρομικό σχεδόν άχρηστο καθώς έλκεται από τη βαρύτητα ενός φεγγαριού.
Καθώς το καταδρομικό κινείται προς την επιφάνεια του φεγγαριού, ο Maul δραπετεύει χρησιμοποιώντας ένα λεωφορείο πιθανώς στο Outer Rim όπου γίνεται γνωστός ως Crimson Dawn όπως φαίνεται στο Solo: A Star Wars Story.
Ο Rex και η Ahsoka χρησιμοποιούν ένα Y-Wing για να προσγειωθούν με ασφάλεια στην επιφάνεια του φεγγαριού καθώς το καταδρομικό συντρίβεται σκοτώνοντας όλους τους κλώνους που βρίσκονται στο πλοίο. Οι δυο τους θάβουν τους πεσόντες συντρόφους τους και η Ahsoka αφήνει το σπαθί της στον τάφο.
Το επεισόδιο τελειώνει με ένα τάγμα στρατιωτών καταιγίδας που ερευνούν το σημείο της συντριβής που καλύπτεται τώρα από χιόνι. Ο Darth Vader είναι μαζί τους. Ο Vader βρίσκει το φωτόσπαθο της Ahsoka. αυτό που της είχε χαρίσει στο "Old Friends Not Forgotten", το ένατο επεισόδιο της τελευταίας σεζόν.
Η Filoni είπε στο ABC News, "Ελπίζω οι θαυμαστές να φύγουν από ένα επίπεδο πολύ ικανοποιημένοι και ελπίζω να φύγουν με μεγαλύτερη κατανόηση, ειδικά για τους Τζεντάι και τη δύναμη και τι σημαίνει όλα σε αυτήν την ιστορία. Είναι πραγματικά για το χαρακτήρες στο τέλος."
Μετά τον πόλεμο των κλώνων
Η ιστορία της Ahsoka συνεχίζεται μετά τη σειρά. Το μυθιστόρημα Ahsoka, γραμμένο από τον Ε. Κ. Ο Johnston, ακολουθεί το ταξίδι της Ahsoka ένα χρόνο μετά το Order 66 και διηγείται πώς γνώρισε τον Bail Organa, τον υιοθετημένο πατέρα της Leia, και εντάχθηκε στην εξέγερση.
Η Η Ahsoka εμφανίζεται στις δύο πρώτες σεζόν του Star Wars Rebels που διαδραματίζεται 14 χρόνια μετά το The Clone Wars ως πράκτορας των επαναστατών. Κατά τη διάρκεια της δεύτερης σεζόν, η Ahsoka ανακαλύπτει την αλήθεια ότι ο πρώην αφέντης της, Anakin Skywalker, είναι ο Darth Vader. Οι δυο τους τσακώνονται και η μοίρα της Ahsoka έμεινε αμφίρροπη. Ωστόσο, στην τέταρτη σεζόν, αποκαλύφθηκε ότι η Ahsoka σώθηκε από τον Ezra, τον πρωταγωνιστικό χαρακτήρα της σειράς. Η Ahsoka ζει για να δει το τέλος της αυτοκρατορίας.
Η Ahsoka είχε μια φωνή στο The Rise of Skywalker και φημολογείται ότι θα εμφανιστεί στη δεύτερη σεζόν του The Mandalorian.
